Από το 1900 ξεκινά, με σύσταση ειδικής επιτροπής, η προσπάθεια για τη συγχώνευση του Παναχαϊκού με την ΓΕΠ, των δύο σωματείων δηλαδή που προέκυψαν από την διάσπαση του Παναχαϊκού το 1894.

Αφορμή για την προσπάθεια ήταν το πσό που θα έπρεπε να καταβάλουν ως συνδρομή ετησίως στον ΣΕΓΑΣ, και που είχε χαρακτηριστεί υπέρογκο για τα ταμεία τους.

Η μακρά περίοδος παρακμής του πατραϊκού αθλητισμού, αμέσως μετά την Μεσολυμπιάδα (1906), έως και το 1920 (περίοδος πολιτικών ταραχών και πολλών πολέμων), ανέστειλε την προσπάθεια για συγχώνευση (η πρώτη «απόφαση» είχε παρθεί το 1914), που πραγματοποιήθηκε τελικά το 1923 καθώς άκαρπες αποδείχθηκαν οι προσπάθειες του 1900, 1905, 1908, 1909, 1910, 1914, 1919, 1922.

Σημειώνεται πως όλα αυτά τα χρόνια οι δύο σύλλογοι σχεδόν ήσαν σε αδράνεια, δεν έχει καταγραφεί άλλωστε η σύνθεση των Δ.Σ. του μεν ΠΓΣ (1912-1923) της δε ΓΕΠ (1915-1922). Για μερικούς μήνες μετά την ίδρυσή της, η Παναχαϊκή αναφερόταν ως ΠΓΕΠ, δηλαδή Παναχαϊκή Γυμναστική Ενωση Πατρών.